Oncogenetique
Prédispositions héréditaires aux cancers
Périmètre de la veille
Sélection hebdomadaire de publications sur les variants constitutionnels pathogènes et probablement pathogènes dans les gènes majeurs de prédisposition au cancer (BRCA1/2, TP53, PALB2, ATM, CHEK2, CDH1, syndrome de Lynch — MLH1, MSH2, MSH6, PMS2). Couvre les études de pénétrance et d'expressivité, la surveillance et la chirurgie prophylactique chez les porteurs, les thérapies ciblées disponibles pour les porteurs constitutionnels (inhibiteurs PARP, immunothérapie), et le mainstreaming du test germinal en oncologie clinique.
Critères d'inclusion / exclusion
Inclus
- ✓Variants constitutionnels pathogènes/LP dans des gènes de prédisposition au cancer
- ✓Études de pénétrance et d'expressivité
- ✓Essais cliniques impliquant des porteurs germline
- ✓Recommandations institutionnelles (ESMO, NCCN, INCa, ACMG)
- ✓Nouvelles corrélations génotype-phénotype
Exclus
- ✕Oncologie somatique pure (sans composante germline)
- ✕Variants somatiques acquis
- ✕Études sans implication directe pour les porteurs constitutionnels
- ✕Revues sans données originales si jugées sans plus-value
Méthodologie de scoring
Chaque article est évalué sur 10 points. Seuil d'inclusion : score ≥ 5.
- Impact clinique (0–3)Critère moteur. +3 : change la pratique immédiatement (recommandation de dose CPIC A, chirurgie prophylactique, outil déployable). +2 : impact probable à court terme. +1 : apport indirect au conseil ou à la compréhension. 0 : intérêt fondamental uniquement.
- Solidité de l'évidence (0–3)+3 : causalité robuste — fonctionnel + ségrégation multi-familles, grande cohorte prospective, ou RCT. +2 : bonne évidence — fonctionnel seul de qualité, cohorte ≥10 familles ou ≥100 patients. +1 : évidence partielle. 0 : données préliminaires ou case report seul.
- Nouveauté (0–2)+2 : élément inédit (nouveau gène, nouvelle interaction CPIC A/B, outil breakthrough). +1 : extension significative (expansion phénotypique, reclassification VUS→P/LP, réplication importante). 0 : réplication mineure ou revue sans données nouvelles.
- Effectif / robustesse (0–1)+1 si ≥5 cas indépendants, ≥100 patients génotypés, cohorte ≥1000, code open source (bioinfo), ou méta-analyse ≥5 études. 0 sinon.
- Qualité du journal (0–1)+1 pour un journal à comité de lecture reconnu dans la spécialité (Nat Genet, AJHG, Genet Med, JCO, Pharmacogenomics J, Nat Methods…). 0 sinon.
- Pénalité preprint (−1)−1 pour les preprints bioRxiv/medRxiv non encore évalués par les pairs. Le preprint reste inclus s'il apporte une information majeure.
Note spécifique à ce domaine : En oncogénétique, l'impact clinique est le critère moteur (0–3 pts). Le score maximum est attribué aux études modifiant une recommandation de surveillance, ouvrant l'accès aux inhibiteurs PARP ou motivant une chirurgie prophylactique. La solidité de l'évidence (0–3 pts) valorise les grandes cohortes de porteurs et les études de pénétrance prospectives.
Sources consultées
- —PubMed — requête BRCA1/2, TP53, PALB2, Lynch, prédisposition héréditaire
- —Genetics in Medicine, Journal of Medical Genetics, EJHG
- —Journal of Clinical Oncology, Annals of Oncology
- —Nature Genetics, NEJM (cas exceptionnels à haut impact)
Auteur
Document à usage informatif — ne constitue pas un avis médical.