La génomique clinique, lue et commentée pour vous

Le protéome sérique de 424 patients du 100,000 Genomes Project restés sans diagnostic après séquençage de génome a été profilé par l'essai Olink Explore 1536 (1463 protéines). Chez 13 patients, la détection d'une protéine sérique anormalement basse (z-score < -2) a conduit à un diagnostic génétique confirmé, en résolvant un variant de signification incertaine ou en orientant une réanalyse ciblée du génome. Chez 23 patients supplémentaires (64 % des trouvailles), la convergence entre protéine abaissée et variants priorisés par Exomiser a fait émerger des associations gène-maladie candidates, dont un variant faux-sens hétérozygote de TIE1 (fréquence allélique gnomAD 0,006 %) présent chez un patient au taux sérique de TIE1 effondré (z-score = -5,12) et chez son père, tous deux atteints de la même cardiopathie monogénique, et absent de tous les autres participants. Les variants faux-sens (52,5 %) et de région d'épissage (27,5 %) représentent la majorité des variants retenus.