Pharmacogenetique
Pharmacogénétique clinique
Périmètre de la veille
Interactions gène-médicament actionnables en pratique clinique. Veille centrée sur les variants CPIC Level A et B (CYP2D6, CYP2C19, DPYD, TPMT, SLCO1B1, HLA-B*57:01, HLA-B*15:02, NUDT15...), les programmes de génotypage préemptif en milieu hospitalier, les phénoconversions médicamenteuses (inhibiteurs/inducteurs enzymatiques), les recommandations de dose et les alertes sur les effets indésirables graves à déterminisme génétique. Inclut les mises à jour des référentiels CPIC et DPWG.
Critères d'inclusion / exclusion
Inclus
- ✓Variants CPIC Level A ou B, ou DPWG recommandation forte
- ✓Études cliniques sur la prescription guidée par PGx
- ✓Mises à jour des recommandations CPIC/DPWG
- ✓Impact sur les effets indésirables graves
- ✓Génotypage préemptif à l'échelle hospitalière
Exclus
- ✕PGx purement préclinique (in vitro, modèles animaux)
- ✕Études sans implication clinique directe
- ✕Biomarqueurs somatiques uniquement
- ✕Interactions médicamenteuses sans composante génétique
- ✕Études sur des variants de signification incertaine (VSI)
Méthodologie de scoring
Chaque article est évalué sur 10 points. Seuil d'inclusion : score ≥ 5.
- Impact clinique (0–3)Critère moteur. +3 : change la pratique immédiatement (recommandation de dose CPIC A, chirurgie prophylactique, outil déployable). +2 : impact probable à court terme. +1 : apport indirect au conseil ou à la compréhension. 0 : intérêt fondamental uniquement.
- Solidité de l'évidence (0–3)+3 : causalité robuste — fonctionnel + ségrégation multi-familles, grande cohorte prospective, ou RCT. +2 : bonne évidence — fonctionnel seul de qualité, cohorte ≥10 familles ou ≥100 patients. +1 : évidence partielle. 0 : données préliminaires ou case report seul.
- Nouveauté (0–2)+2 : élément inédit (nouveau gène, nouvelle interaction CPIC A/B, outil breakthrough). +1 : extension significative (expansion phénotypique, reclassification VUS→P/LP, réplication importante). 0 : réplication mineure ou revue sans données nouvelles.
- Effectif / robustesse (0–1)+1 si ≥5 cas indépendants, ≥100 patients génotypés, cohorte ≥1000, code open source (bioinfo), ou méta-analyse ≥5 études. 0 sinon.
- Qualité du journal (0–1)+1 pour un journal à comité de lecture reconnu dans la spécialité (Nat Genet, AJHG, Genet Med, JCO, Pharmacogenomics J, Nat Methods…). 0 sinon.
- Pénalité preprint (−1)−1 pour les preprints bioRxiv/medRxiv non encore évalués par les pairs. Le preprint reste inclus s'il apporte une information majeure.
Note spécifique à ce domaine : En pharmacogénétique, l'impact clinique est le critère moteur (0–3 pts) : une recommandation de dose CPIC niveau A applicable immédiatement vaut +3. La solidité de l'évidence (0–3 pts) distingue un RCT sur génotypage préemptif d'une étude rétrospective. Un article avec recommandation CPIC A + grande cohorte prospective peut atteindre 9–10/10.
Sources consultées
- —PubMed — requête CYP2D6, CYP2C19, DPYD, pharmacogénétique clinique
- —Pharmacogenomics Journal, Clinical Pharmacology & Therapeutics
- —CPT: Pharmacometrics & Systems Pharmacology
- —British Journal of Clinical Pharmacology
- —Référentiels CPIC (cpicpgx.org) et DPWG (knmp.nl)
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Document à usage informatif — ne constitue pas un avis médical.