CGG repeat expansions in Charcot-Marie-Tooth disease: insights from the 100 000 Genomes Project.
Outil / méthode
Recherche d'expansions CGG de NOTCH2NLC et LRP12 par WGS short-read (ExpansionHunter) dans 560 CMT européens non résolus
Résumé
Les expansions CGG de NOTCH2NLC et LRP12 ont été récemment identifiées comme cause de maladie de Charcot-Marie-Tooth (CMT) dans 1,2–10,6 % des cas non résolus en Asie orientale. Cette étude exploite le WGS short-read de 560 patients CMT non résolus du 100 000 Genomes Project (majorité d'ascendance nord-européenne) et 32 509 contrôles non neurologiques. Les expansions dans NOTCH2NLC, LRP12, RILPL1, NUTM2B-AS1 et ABCD3 sont absentes chez les patients CMT. La distribution de la taille des allèles intermédiaires varie significativement selon l'ascendance, avec des allèles non-pathogènes plus grands chez les Asiatiques de l'Est, expliquant leur propension à l'expansion dans la plage pathogène.
Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.
Analyse
Ce résultat négatif est cliniquement important : il confirme que les expansions CGG de NOTCH2NLC/LRP12 ne sont pas une cause significative de CMT dans les populations d'ascendance européenne. La démonstration que la distribution des allèles intermédiaires est ancestry-spécifique est utile pour l'interprétation des rapports WGS : un allèle intermédiaire NOTCH2NLC chez un patient européen a une signification différente de chez un patient asiatique.
Pourquoi ce score ?
Impact clinique : 2/3 · Solidité de l'évidence : 3/3 · Nouveauté : 1/2 · Effectif : 1/1 · Qualité du journal : 0/1 → Total : 7/10
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