Diagnostic utility of clinical genome reanalysis in rare pediatric disorders using long-read sequencing

N/A (réanalyse génomique pédiatrique multi-gènes)

Réanalyse génomique par LRS (PacBio HiFi) sur des cas pédiatriques non diagnostiqués après WES ou WGS short-read : détection de SV manqués, d'expansions de répétitions en tandem (STR), de variants dans des régions difficiles (dark genes), et de phasing améloré ; comparaison des rendements diagnostiques

Évaluation du gain diagnostique de la réanalyse génomique par séquençage long-read (LRS, PacBio HiFi) sur des cas pédiatriques non diagnostiqués après WES ou WGS short-read standard. Le LRS détecte des variants additionnels par plusieurs mécanismes : variants de structure (SV) complexes manqués, expansions de répétitions en tandem (STR) dans des gènes de TND, variants dans des régions difficiles d'accès (dark genes), et phasing haplotypique amélioré pour les variants récessifs. Ces résultats documentent l'utilité clinique du LRS comme deuxième ligne après échec du diagnostic standard.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

La réanalyse par LRS est la stratégie d'extension du diagnostic la plus efficace disponible pour les cas pédiatriques post-WES/WGS négatifs. La détection de STR et de dark genes (SMN1, PMS2, GBA) est particulièrement précieuse. À intégrer dans les protocoles de réanalyse des cas non résolus après 18–24 mois.

HGG Advances (Cell Press) +2 ; rendement additionnel LRS sur WGS-négatifs pédiatriques +3 ; SV + STR + dark genes détectés +2 ; impact sur les cas non résolus +1