Targeted long-read RNA sequencing for rare disease diagnosis and variant interpretation

N/A (RNA-seq long-read ciblé, cohorte maladies rares)

Long-read RNA-seq ciblé sur des gènes d'intérêt (panels de gènes de maladies rares) → résolution des variants d'épissage avec profil d'isoformes complet, phasing, et couverture profonde des transcrits rares ; applicable avec des échantillons de faible qualité et des tissus variés

Développement et validation d'une approche de RNA-seq long-read ciblé (targeted LR RNA-seq) pour le diagnostic des maladies rares et l'interprétation des variants. La méthode cible des panels de gènes d'intérêt clinique, permettant une couverture profonde des transcrits avec des profils d'isoformes complets. Elle est applicable avec des échantillons de faible qualité ARN et des tissus variés (sang, fibroblastes). La validation sur des cohortes de maladies rares démontre la résolution de variants d'épissage non interprétables par les méthodes standard.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le RNA-seq ciblé LR est positionné comme le complément idéal du WGS LRS : plus profond et plus informatif que le RNA-seq short-read pour les gènes d'intérêt, moins coûteux qu'un RNA-seq LRS génome entier. Le ciblage sur panels cliniques (comme les panels de myopathies, TND, neuropathies) en fait un outil scalable pour les laboratoires de diagnostic. Approche à surveiller pour l'implémentation en 2026-2027.

Science Advances (top journal) +2 ; ciblage panels de gènes (scalabilité clinique) +2 ; applicable avec échantillons faible qualité +2 ; complémentaire du WGS LRS pour les variants d'épissage +2