Novel Haplotype-Based Noninvasive Prenatal Diagnosis for Recessive Single-Gene Disorders: A Proof-of-Concept Study.

Haplotypage direct par long-read sequencing stLFR sans membres de la famille

Une nouvelle approche de diagnostic prénatal non invasif (DPNI) par haplotypage direct (DiHNIPD) utilisant le séquençage stLFR (single-tube long fragment read) a été développée pour les maladies récessives monogéniques. Les haplotypes parentaux sont reconstruits par WGS stLFR et les héplotypes fœtaux déduits via un modèle de Markov caché avec algorithme de Viterbi. Sur 23 couples à risque, DiHNIPD a correctement déduit 23 génotypes fœtaux avec 100 % de concordance par rapport au diagnostic invasif. La méthode ne nécessite ni membres de la famille, ni amplification PCR, ni appareils coûteux.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

La concordance 100 % sur 23 cas est encourageante mais appelle à une réplication dans une cohorte plus large avant adoption clinique. L'absence de besoin de séquençage de proches est un avantage pratique majeur pour les familles isolées ou dont les membres clés sont décédés. La validation reste à faire pour des pathologies à grande variabilité allélique ou dans des régions génomiquement complexes.

Impact clinique : 2/3 · Solidité de l'évidence : 2/3 · Nouveauté : 1/2 · Effectif : 1/1 · Qualité du journal : 0/1 → Total : 6/10