Unraveling a Diagnostic Enigma: A TECPR2 Case Solved Through Multi-Omic Genomics.
Variant / mécanisme
Deux VUS TECPR2 en trans confirmés pathogènes par long-read + multi-omics
Résumé
Une adolescente présentant une déficience intellectuelle syndromique avec anomalies neuromusculaires a été analysée par exome trio, transcriptomique RNA-seq et protéomique musculaire. L'exome trio a identifié deux variants TECPR2 hétérozygotes (c.480G>A et c.2846C>A), initialement VUS. Le long-read sequencing a phassé les deux variants en trans. Les études fonctionnelles ont validé leur pathogénicité par des anomalies d'expression (RNA-seq) et de fonction (protéomique), permettant la reclassification et un diagnostic définitif. Ce cas illustre l'apport du diagnostic multi-omique intégré pour les VUS dans des gènes ultra-rares.
Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.
Analyse
Ce cas démontre la valeur pratique du long-read pour phaser deux variants hétérozygotes et du multi-omics pour confirmer leur pathogénicité sans ségrégation familiale disponible. Pour TECPR2, gène très rare et mal caractérisé, ces outils permettent de résoudre des cas qui resteraient en errance diagnostique indéfiniment.
Pourquoi ce score ?
Impact clinique : 2/3 · Solidité de l'évidence : 2/3 · Nouveauté : 1/2 · Effectif : 0/1 · Qualité du journal : 0/1 → Total: 5/10
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