Non-coding structural variants disrupt FOXG1 transcriptional regulation in early neurodevelopment

Variants structuraux non-codants en aval de FOXG1, disruption d'une région régulatrice critique de ~124 kb contenant des enhancers neurodéveloppementaux

Deux variants structuraux non-codants situés en aval de FOXG1 sont identifiés chez des individus présentant un tableau de type syndrome FOXG1, permettant de délimiter une région régulatrice critique d'environ 124 kb. Le profilage épigénomique (ATAC-seq, H3K27ac ChIP-seq) et des essais d'activité enhancer in vivo (zebrafish) caractérisent et valident plusieurs éléments régulateurs dans cette région. Ces résultats expliquent le mécanisme pathogénique des variants structuraux non-codants de FOXG1 et fournissent des balises précises pour l'interprétation diagnostique.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'élucidation de la région régulatrice FOXG1 est cliniquement pertinente car les variants structuraux non-codants sont invisibles par exome et panel classiques — seul le WGS ou une CGH-array de haute résolution peut les détecter. Ce travail fournit des coordonnées précises pour annoter ces variants en routine et réduire l'errance diagnostique dans les syndromes FOXG1 sans variant codant.

Impact clinique : 2/3 · Solidité de l'évidence : 2/3 · Nouveauté : 2/2 · Effectif : 0/1 · Statut de publication : 1/1 → Total : 7/10