Pedigree and Functional Analysis of Two Cryptic OTC Variants Causing Ornithine Transcarbamylase Deficiency in Two Unrelated Families
Variant / mécanisme
OTC (2 variants cryptiques indépendants, lié à l’X)
Variants cryptiques (synonymes ou dans le cadre de lecture) dans OTC → activation de pseudo-exons ou altération d’épissage → perte de fonction ; non détectés par le screening standard (WES), nécessitent ARN-seq ou analyse fonctionnelle dédiée
Résumé
Identification et caractérisation fonctionnelle de deux variants cryptiques (synonymes/in-frame) dans OTC chez deux garçons non apparentés atteints de déficit en ornithine transcarbamylase (OTCD), d’hyperammonémie et diagnostiqués par WES. Les variants cryptiques, mal caractérisés par le dépistage de routine, affectent l’épissage ou la stabilité de l’ARNm. L’analyse fonctionnelle par pedigree, ARN-seq et étude d’activité enzymatique confirme leur pathogénicité. Environ 600 variants OTC pathogènes sont répertoriés ; les variants cryptiques restent la fraction la plus mal détectée.
Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.
Analyse
OTCD est le trouble du cycle de l’urée le plus fréquent (lié à l'X). Les variants cryptiques représentent un angle mort du diagnostic WES classique. L’ARN-seq systématique sur les cas suspects OTCD sans variant WES identifié améliorerait significativement le rendement diagnostique.
Pourquoi ce score ?
variants cryptiques non-canoniques + analyse fonctionnelle +3 ; pedigreee 2 familles indépendantes +2 ; impact diagnostique (WES insuffisant) +2
Mots-clés
Chaque mercredi · Sélection commentée · Gratuit · Désabonnement en 1 clic