Disruption of CTCF binding by germline non-coding variants in CDKN2B suppress CDKN2B expression in melanoma-prone families

Variants non-codants germinaux disruption de sites de liaison CTCF en aval de CDKN2B, répression transcriptionnelle, mécanisme alternatif de prédisposition au mélanome

Chez des familles mélanome-prone liées au locus 9p21 mais sans variant pathogène codant de CDKN2A, trois variants non-codants rares sont identifiés dans deux familles et un cas sporadique. Ces variants disrumpent des sites de liaison du facteur architectural CTCF en aval de CDKN2B, entraînant une répression transcriptionnelle de CDKN2B — suppresseur de tumeur contigu à CDKN2A. Cette étude établit CDKN2B comme nouveau gène de prédisposition au mélanome via un mécanisme épigénétique régulateur, détectable uniquement par WGS ou génotypage non-codant ciblé.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'identification de variants non-codants pathogènes dans un gène contigu à CDKN2A pour le mélanome familial est une avancée majeure : elle explique une fraction des familles 9p21-liées non résolues par séquençage standard et établit un mécanisme CTCF inédit en oncogénétique du mélanome. Ce préprint devra être validé en journal peer-reviewed mais le mécanisme est solide.

Impact clinique : 3/3 · Solidité de l'évidence : 3/3 · Nouveauté : 2/2 · Effectif : 1/1 · Statut de publication : 0/1 → Total : 9/10