Multi-omics analysis in suspected hereditary breast and ovarian cancer cases reveals novel candidate susceptibility factors.

Analyse multi-omics (WGS, WTS, optical genome mapping, éléments mobiles) chez des patients HBOC sans variant dans les gènes cœur ; intégration d'un score polygénique

Plus de 80 % des patients répondant aux critères de cancer héréditaire du sein et de l'ovaire (HBOC) n'ont pas de variant pathogène dans BRCA1, BRCA2 et les autres gènes cœur. Les auteurs étudient 134 patients par WGS, séquençage transcriptomique, cartographie optique du génome et analyse des éléments mobiles. Des variants (probablement) pathogènes de gènes de réparation de l'ADN sont identifiés chez 18 patients, dont plusieurs hélicases RECQ, une délétion intragénique de FANCM et six insertions rares d'éléments mobiles. L'ajout d'un score polygénique (PRS306) déplace le risque estimé de cancer du sein d'au moins 5 points chez une partie des femmes, à la hausse comme à la baisse.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Illustre bien l'apport d'une approche multi-omics pour la « part manquante » du HBOC, en captant des variants (structuraux, introniques, éléments mobiles) invisibles aux panels classiques. Les facteurs restent candidats et le PRS n'est pas encore prêt pour la clinique, mais le message de fond — dépasser les panels ciblés vers le WGS/transcriptome — est solide.

Analyse par Dr Thibaut Benquey