Genotype-Phenotype Correlation Through Breakpoint Characterization of a Genomically Balanced Complex Chromosomal Rearrangement Using Long Read Sequencing

Séquençage long-read pour caractérisation des breakpoints d'un CCR à 8 chromosomes, résolution impossible par techniques conventionnelles

Un garçon présentant une déficience intellectuelle, un retard de développement et une dysmorphie est exploré par caryotype, FISH, CGH-array puis séquençage long-read, qui permet de caractériser un réarrangement chromosomique complexe équilibré (CCR) impliquant 8 chromosomes. L'analyse des breakpoints identifie trois gènes interrompus : NLGN4X (neuroligine, lié au spectre autistique et à la DI), LAMA4 et ALG6. Ce cas illustre la supériorité du séquençage long-read pour résoudre les CCR échappant aux techniques conventionnelles, et établit une corrélation génotype-phénotype précise pour ce patient.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Les CCR équilibrés restent l'un des angles morts du diagnostic génomique classique : invisibles à l'array CGH, partiellement visibles au caryotype. Ce cas paradigmatique justifie l'intégration du long-read comme outil de second recours pour les TND ou anomalies congénitales avec karyotype complexe ou CGH-array normal.

Impact clinique : 2/3 · Solidité de l'évidence : 2/3 · Nouveauté : 2/2 · Effectif : 0/1 · Statut de publication : 1/1 → Total : 7/10