Bridging the Functional Gap by Synergy of Exome/Genome and RNA Sequencing: A Systematic Semi-quantitative Review Demonstrating Enhanced Diagnostic Yield in Genetic Diagnostics.

Ajout du séquençage d'ARN au WES/WGS pour confirmer, reclasser ou découvrir des variants

Cette revue systématique semi-quantitative (200 études, 2014-2024) évalue l'apport du séquençage d'ARN combiné au WES/WGS. Le taux diagnostique moyen pondéré du WES/WGS suivi de RNA-seq est de 0,44 contre 0,37 pour le WES/WGS seul, avec une tendance à l'amélioration (OR 1,31). Chez les patients non diagnostiqués par WES/WGS, le RNA-seq apporte 5,4 % de diagnostics par confirmation ou reclassification et 3,3 % par découverte de nouveaux variants. Les échantillons tissulaires surpassent le sang pour le rendement du RNA-seq.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Une synthèse utile qui quantifie l'apport incrémental, modeste mais réel, du transcriptome en complément du WES/WGS, surtout pour trancher les variants candidats et les effets d'épissage. Le choix du tissu apparaît déterminant, ce qui a des implications pratiques d'accès. Le RNA-seq s'impose comme un second niveau raisonné plutôt qu'un test systématique.

Analyse par Dr Thibaut Benquey