Identifying the Potential Role of Missense KIRREL3 Variants in Neurodevelopmental Phenotypes: A Case Series.

Variants faux-sens rares de KIRREL3, gène exprimé dans les ganglions de la base et l'amygdale en développement, prédits délétères sur la base du score REVEL.

KIRREL3, exprimé dans les ganglions de la base et l'amygdale en développement, est déjà associé aux troubles du neurodéveloppement. Via GeneMatcher et le projet SPARK (Simons Foundation Powering Autism Research), les auteurs ont réuni 26 individus porteurs de variants faux-sens rares et distincts de KIRREL3, prédits délétères d'après leur score REVEL. Tous les probands avaient un diagnostic de trouble du neurodéveloppement : trouble du spectre de l'autisme, retard global de développement, déficience intellectuelle ou trouble des apprentissages. Une revue complète de la littérature a par ailleurs retrouvé 10 variants faux-sens rares de KIRREL3 chez 13 individus ayant au moins un diagnostic de trouble du spectre de l'autisme ou de déficience intellectuelle. Les auteurs concluent à un rôle potentiel des variants faux-sens de KIRREL3 dans les troubles du neurodéveloppement, qui justifie des travaux complémentaires.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le recrutement par appariement de génotypes est ici une limite dont il faut tenir compte au moment de rédiger un compte rendu : réunir 26 porteurs tous atteints ne démontre pas l'association, puisque le mode même de recrutement ne fait remonter que les cas phénotypés. En l'absence de comparaison à une population témoin, de ségrégation familiale et de preuve fonctionnelle, un variant faux-sens de KIRREL3 prédit délétère par REVEL reste un variant de signification incertaine, et le score in silico ne suffit pas à faire basculer la classification ACMG. L'utilité pratique de cette série est de fournir une base d'appariement phénotypique pour les cas isolés, pas de conclure la discussion diagnostique.

Analyse par Dr Thibaut Benquey