Genomic ascertainment refines the population prevalence and phenotype associations of germline TERT variants

TERT

Variants germinaux délétères hétérozygotes de TERT, sous-unité catalytique de la télomérase

Les cohortes de maladies des télomères recrutées en clinique sont biaisées vers les formes précoces et complexes. Les auteurs ont extrait les variants de TERT des exomes de l'UK Biobank (469 377 exomes) et de la collaboration Geisinger-Regeneron DiscovEHR (170 503 exomes), classés selon des critères ACMG/AMP modifiés, et comparé les porteurs hétérozygotes à des témoins sur les codes CIM-10 des dossiers électroniques. Soixante-quatre variants délétères ont été trouvés chez 203 participants de l'UK Biobank et 32 chez 138 participants de DiscovEHR, soit une prévalence de 1 sur 2 312 et 1 sur 1 235. Le risque de fibrose pulmonaire était significativement augmenté dans les deux cohortes (OR 10,9 ; IC 95 % 6,11-19,45 et OR 6,64 ; IC 95 % 3,31-13,3), tandis que les associations avec l'atteinte hépatique (OR 2,4) et le carcinome épidermoïde ORL (OR 5,75) n'étaient retrouvées que dans l'UK Biobank.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le message pour le conseil est net : un variant délétère de TERT découvert hors contexte clinique expose surtout à un risque pulmonaire, l'excès hépatique et ORL étant inconstant d'une cohorte à l'autre. Les phénotypes reposent sur des codes CIM-10, donc sans adjudication clinique ni mesure de longueur des télomères, et le biais du volontaire sain de l'UK Biobank peut jouer dans les deux sens. Les porteurs identifiés par ascertainment génomique ont un pronostic probablement plus favorable que ceux vus en consultation spécialisée.

Analyse par Dr Thibaut Benquey