Identification of a novel intergenic EPCAM-MSH2 deletion causing EPCAM-associated Lynch syndrome

Délétion intergénique EPCAM-MSH2 novel perturbant la terminaison transcriptionnelle EPCAM, générant des transcrits de lecture continue et un silençage épigénétique de MSH2

Une nouvelle délétion intergénique entre EPCAM et MSH2 est identifiée dans une famille atteinte de syndrome de Lynch. Cette délétion, localisée à l'extrémité 3' d'EPCAM, perturbe la terminaison transcriptionnelle d'EPCAM, générant des transcrits de lecture continue qui entraînent un silençage épigénétique de MSH2 dans les tissus exprimant EPCAM. Ce mécanisme est caractéristique du syndrome de Lynch EPCAM-associé, mais la délétion décrite ici est distincte des délétions précédemment rapportées et précise les limites critriques de la région EPCAM-MSH2 pour ce mécanisme.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Les délétions EPCAM-MSH2 causant un Lynch par mécanisme épigénétique sont souvent manquées par les analyses NGS conventionnelles ciblées sur les variants codants. Ce nouveau type de délétion intergénique illustre l'importance des analyses de grandes délétions (MLPA, CGH-array) et du séquençage long-read dans le bilan Lynch des patients sans variant codant MSH2.

Impact clinique : 2/3 · Solidité de l'évidence : 2/3 · Nouveauté : 2/2 · Effectif : 0/1 · Statut de publication : 1/1 → Total : 7/10