Population-based genomic detection of childhood cancer predisposition using newborn dried blood spots.

Séquençage ciblé de 11 gènes de prédisposition (RB1, TP53, SMARCB1, WT1, RET, SUFU, PTCH1, DICER1, APC, PHOX2B) sur ADN extrait de cartes de sang séché néonatal archivées.

Les auteurs ont identifié, dans une cohorte de naissances du Michigan (1987-2020), tous les enfants ayant développé une tumeur solide ou du système nerveux central avant l'âge de 8 ans (n = 1948), puis séquencé 11 gènes de prédisposition sur l'ADN de leurs cartes de sang séché néonatal archivées. Un variant germinal pathogène ou probablement pathogène a été retrouvé chez 6,8 % des cas (n = 132), le plus souvent dans RB1 (n = 69) et TP53 (n = 24), puis SMARCB1, WT1, RET, SUFU, PTCH1, DICER1, APC et PHOX2B. Environ 1 nouveau-né sur 27 000 développe une tumeur précoce associée à un variant P/LP. La prévalence du variant germinal atteint 100 % dans le carcinome médullaire de la thyroïde, 40 % dans le rétinoblastome et 11 à 30 % pour cinq autres diagnostics, avec une spécificité gène-tumeur marquée (p < 0,001). Ces variants sont rares dans les jeux de données de nouveau-nés sains et dans gnomAD.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le design retrospectif à partir de cartes de Guthrie archivées est élégant : il mesure la performance théorique d'un dépistage néonatal sans avoir à le déployer, et le chiffre de 1/27 000 donne enfin un ordre de grandeur discutable en comité. Deux réserves pour la consultation : la démonstration porte sur les enfants ayant effectivement développé un cancer, donc elle ne dit rien de la pénétrance chez les nouveau-nés porteurs qui n'en développeront pas, ni du volume de surdiagnostic et d'angoisse parentale généré à l'échelle d'une population. La spécificité gène-tumeur observée est en revanche un argument fort pour restreindre un éventuel panel néonatal à des gènes où la surveillance précoce change réellement le pronostic.

Analyse par Dr Thibaut Benquey