Resolving CYP2D6 Structural Complexity with Long-Read Sequencing: Implications for Tamoxifen Precision Dosing in Thai Breast Cancer Patients.

Séquençage long-read (Oxford Nanopore) résolvant les allèles structurellement complexes de CYP2D6 ; score d'activité associé à l'exposition à l'endoxifène

La bioactivation du tamoxifène en endoxifène par le CYP2D6 conditionne son efficacité, mais les allèles structurellement complexes fréquents en Asie compliquent le génotypage conventionnel. Les auteurs appliquent le séquençage long-read Oxford Nanopore à 492 patientes thaïlandaises avec cancer du sein (analyse multivariée sur 361 sous tamoxifène standard). Le long-read identifie 82 diplotypes distincts et résout les variations structurales complexes, dont la duplication non identique CYP2D636+10. Le score d'activité CYP2D6 est le déterminant le plus fort de l'exposition à l'endoxifène, 46,55 % des patientes ayant une fonction enzymatique diminuée.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Belle démonstration de l'apport du long-read pour un gène pharmacogénétique notoirement difficile à génotyper, avec une conséquence clinique directe (dosage du tamoxifène). Confirme que la résolution des allèles structuraux du CYP2D6 n'est pas qu'un exercice technique : elle change la classification du phénotype et donc la décision thérapeutique.

Analyse par Dr Thibaut Benquey