Nanopore-based haplotype-resolved X-chromosome inactivation analysis for clinical severity assessment in X-linked disorders: an AIFM1 family study with proof-of-concept application to a mosaic PDHA1 carrier

Workflow Nanopore (long-read) haplotype-résolu pour l'analyse clinique de l'inactivation du chromosome X (XCI) et l'évaluation de la sévérité des maladies liées à l'X chez les conductrices

Un workflow Nanopore haplotype-résolu est développé pour l'analyse clinique de l'inactivation du chromosome X (XCI) chez les femmes conductrices de variants pathogènes liés à l'X. Appliqué à une famille avec variant AIFM1 présentant une variabilité phénotypique intrafamiliale marquée, le workflow démontre que le biais de XCI corrèle avec la sévérité clinique chez les conductrices. Un proof-of-concept est également réalisé sur une conductrice mosaïque PDHA1, montrant la transférabilité de l'approche.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

La quantification clinique du biais de XCI est un problème récurrent en génétique des maladies liées à l'X — et souvent insuffisamment précise avec les méthodes standard (méthylation HUMARA). Ce workflow Nanopore haplotype-résolu ouvre une voie vers un outil clinique applicable pour le conseil génétique des conductrices, notamment en cas de variabilité phénotypique inexpliquée.