AAVC: an automated framework for high-accuracy ACMG-based variant classification.

Classification ACMG/ClinGen automatisée s'appuyant sur les grandes bases publiques et des prédicteurs in silico.

AAVC est un nouvel outil de classification automatisée des variants selon les standards ACMG et les spécifications ClinGen, exploitant les grandes bases publiques et des prédicteurs in silico. Il atteint 94,39 % de concordance avec les classifications reconnues par la FDA, surpassant les outils existants, et reclasse 55 % des VUS de ClinVar en catégories cliniquement significatives. Appliqué au Variome turc, il a identifié 215 variants pathogènes, probablement pathogènes ou VUS-high dans les gènes à findings secondaires, révélant qu'un individu sur dix porte un génotype actionnable. L'outil est accessible en ligne pour les laboratoires et la recherche.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Dans un espace déjà encombré d'outils ACMG automatisés, AAVC se distingue par une concordance élevée avec les classifications FDA et une capacité notable à trancher les VUS — l'enjeu central du diagnostic exome/génome n'étant plus la capture des variants mais leur interprétation. La proportion d'un porteur sur dix d'un génotype actionnable illustre l'impact potentiel sur les findings secondaires. À valider sur des cohortes diagnostiques prospectives hors contexte turc.

Analyse par Dr Thibaut Benquey