The British Society for Genetic Medicine guidance on managing incidental findings identified during rare disease genomic testing.

Le recours aux grands panels de séquençage haut débit et aux analyses pangénomiques sur puce augmente la probabilité de mettre en évidence un variant hautement actionnable, ou un statut hétérozygote, sans rapport avec le motif de prescription.

Le test génomique met occasionnellement en évidence un variant hautement actionnable sans lien avec le motif de la prescription, pertinent pour le patient testé ou pour sa famille. La British Society for Genetic Medicine publie une recommandation destinée aux cliniciens prescripteurs et aux biologistes des laboratoires de génomique du NHS, qui pose d'abord le principe d'aborder l'éventualité de telles découvertes avec le patient ou les parents lors de la discussion préalable au test. La décision de rendre un variant sans rapport avec l'indication dépend de l'actionabilité clinique, de la pénétrance et de la classification du variant ; un variant pathogène peut être rendu s'il existe des arguments de pénétrance élevée et un traitement ou une surveillance susceptible d'améliorer le pronostic. Le rendu incident d'un statut hétérozygote pour une maladie autosomique récessive n'est en revanche pas recommandé, alors que les grands panels et les analyses pangénomiques en augmentent la fréquence. La recommandation fournit un cadre de rendu illustré par des cas et une liste de gènes de prédisposition au cancer, dans l'objectif d'obtenir une cohérence supérieure à celle de décisions prises au cas par cas, et se veut utilisable dans d'autres systèmes de santé publics dont l'offre génomique se structure.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'apport n'est pas conceptuel — actionabilité, pénétrance, classification sont des critères connus — mais opérationnel : une société savante nationale assume une position écrite, y compris le refus de rendre les statuts hétérozygotes récessifs, ce qui décharge le biologiste d'un arbitrage individuel difficile à défendre devant une famille. La limite est celle du genre, un consensus d'experts sans revue systématique ni évaluation prospective du rapport bénéfice-risque du rendu, et la liste de gènes de prédisposition au cancer devra suivre le rythme des données de pénétrance. La transposition hors du NHS suppose d'accepter le cadre d'un système public où le suivi des porteurs identifiés est organisé et financé, condition qui n'est pas remplie partout.

Analyse par Dr Thibaut Benquey