Arriving at a diagnosis: Effective strategies used by the Undiagnosed Diseases Network.

Stratégies de résolution des impasses diagnostiques — réanalyse et réinterprétation des données d'exome et de génome, appariement de cas, agrégation des données cliniques

Cette étude décrit les stratégies diagnostiques de la deuxième cohorte du réseau américain des maladies non diagnostiquées (UDN, 24 mai 2017 – 30 juin 2023). La proportion de participants déjà explorés par exome ou génome avant inclusion est passée de 40,2 % à 75,0 % au fil du temps. Le taux diagnostique atteint 22,1 % (379/1 713), et c'est la réanalyse ou la réinterprétation de données de séquençage qui a fourni le plus grand nombre de diagnostics — 21,4 % via l'exome antérieur, 17,3 % via le génome réalisé dans l'UDN. L'appariement de cas a été la stratégie de soutien la plus fréquente (25,6 %) ; pour les 26 diagnostics non génétiques, l'agrégation des données cliniques (57,7 %) et les examens cliniques (42,3 %) ont primé. Au total, 235 diagnostics (59,9 %) ont nécessité des démarches de recherche dépassant la prise en charge clinique standard.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le chiffre à retenir n'est pas les 22 % mais le fait que la majorité des diagnostics provienne de données déjà produites : la donnée de séquençage vieillit mieux que le compte rendu qui l'accompagne. Cela plaide pour une réanalyse programmée des exomes et génomes négatifs et pour un accès effectif aux plateformes d'appariement de cas, plutôt que pour une nouvelle prescription. Le revers est que près de 60 % des diagnostics ont exigé des moyens de recherche, difficilement transposables à un laboratoire de routine.

Analyse par Dr Thibaut Benquey