Genetic Spectrum of Cholestasis in Tunisia and Diagnostic Yield of Next-Generation Sequencing: Case Series of 70 Patients.

ABCB11

Hétérogénéité génique des cholestases, dominée ici par la perte de fonction biallélique d'ABCB11 responsable de cholestase intrahépatique familiale progressive de type 2

Environ un quart des cholestases relèvent d'une cause génétique. Les auteurs ont inclus sur dix ans les patients adressés pour cholestase et analysés par panel de 292 gènes et/ou séquençage d'exome, soit 70 patients issus de 66 familles non apparentées. Un diagnostic génétique a été établi dans 70 % des familles, le rendement diagnostique du test moléculaire s'établissant à 62 %. Les diagnostics les plus fréquents étaient la cholestase intrahépatique familiale progressive de type 2 (n = 12), la cholangite sclérosante néonatale (n = 4), le syndrome de lithiase biliaire associée à un déficit en phospholipides (n = 4) et le syndrome d'Alagille (n = 4). Le gène ABCB11 était le plus fréquemment muté (15 cas sur 46), avec deux variants récurrents, c.1062T>A p.(Tyr354Ter) et c.1826_1827dup p.(Ile610GlnfsTer45), retrouvés respectivement dans six et quatre familles.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Deux variants récurrents d'ABCB11 couvrant dix familles sur une cohorte tunisienne de 66 : c'est le type de donnée qui justifie une stratégie de dépistage ciblé des apparentés avant tout élargissement du séquençage. Les populations d'Afrique du Nord restent massivement sous-représentées dans les bases de fréquences alléliques, et chaque série de ce type améliore directement la classification ACMG des variants chez nos patients issus de ces populations. Le rendement de 62 % est à lire comme celui d'un recrutement sélectionné en centre tertiaire, non comme une performance généralisable à toute cholestase.

Analyse par Dr Thibaut Benquey