Allelic Architecture and Clinical Spectrum of RP1-Associated Retinal Dystrophies in a Multicenter Korean Cohort.

RP1

Troncatures de l'exon 4 de RP1 dans les formes dominantes ; allèles tronquants récurrents, dont une insertion Alu, dans les formes récessives

Cette étude multicentrique rétrospective inclut 143 patients coréens atteints de rétinopathie liée à RP1, séquencés dans huit centres entre 2002 et 2025, avec recherche de variants structurels et de phase par relecture des lectures tronquées (soft-clipping), PCR Alu et WGS long-read chez certains patients. Vingt-sept variants de RP1 sont identifiés, dont neuf nouveaux ; toutes les rétinites pigmentaires dominantes s'expliquent par sept troncatures de l'exon 4, tandis que les formes récessives sont dominées par trois allèles tronquants récurrents : c.4196del (p.Cys1399LeufsTer5, 32,2 % des patients), la troncature hypomorphe c.5797C>T (p.Arg1933Ter, 30,8 %) et c.6181del (p.Ile2061SerfsTer12, 31,5 %). Le faux-sens c.6353G>A (p.Ser2118Asn) est retrouvé en cis de c.4196del, phase confirmée en WGS long-read, et l'insertion Alu c.4052_4053ins328 (p.Tyr1352AlafsTer9) est portée par 14 % des patients. Les formes récessives débutent plus tôt que les formes dominantes (16,9 contre 33,5 ans en moyenne, p < 0,001) avec une acuité visuelle initiale plus basse, et le spectre s'étend aux dystrophies maculaires et des cônes (et bâtonnets).

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'insertion Alu portée par 14 % des patients est le point d'alerte : un pipeline exome/génome short-read sans détection des éléments mobiles laisse passer une part notable des diagnostics RP1 dans cette population. La mise en phase de c.4196del et p.Ser2118Asn évite de compter à tort deux allèles distincts chez un patient récessif. Ces fréquences alléliques sont propres à une population coréenne et ne se transposent pas telles quelles ailleurs.

Analyse par Dr Thibaut Benquey