Customized MUC1 Sequencing Enables Diagnosis of Autosomal Dominant Tubulointerstitial Kidney Disease and Unexplained CKD

MUC1

Variants frameshift pathogènes (DupC, DupA) dans la région VNTR de MUC1, générant des néoprotéines MUC1 pathogènes

Le diagnostic génétique de l'ADTKD liée à MUC1 est techniquement difficile, ce qui contribue au sous-diagnostic des maladies rénales héréditaires. Les auteurs ont mis en place une librairie short-read sur mesure, associée à des approches bioinformatiques dédiées à la région VNTR de MUC1, appliquée à 550 patients suspects de maladie rénale héréditaire sans cause génétique identifiée. Vingt-huit patients ont une ADTKD-MUC1, portée par un variant frameshift DupC (près de 90 % des cas) ou DupA (10 %), et plus de la moitié de ces cas n'ont été détectés que grâce à l'analyse bioinformatique spécialisée. Les variants ont été confirmés par Sanger, SNaPshot ou séquençage long-read selon leur localisation et leur type. Intégrée au flux diagnostique de routine, la stratégie augmente le rendement diagnostique tout en évitant l'enchaînement de plusieurs techniques.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Réponse pragmatique à un angle mort connu de l'exome : le VNTR de MUC1 échappe en grande partie à l'analyse standard, et cette série montre qu'une capture dédiée avec une analyse bioinformatique spécifique le rend accessible en short-read. Une ADTKD-MUC1 ne doit donc pas être considérée comme exclue par un exome négatif devant une maladie rénale héréditaire suspectée. La sensibilité de la méthode face au long-read n'est pas mesurée dans l'abstract.

Analyse par Dr Thibaut Benquey