Genetic diagnostic yield of prenatal testing for fetal central nervous system abnormalities: a phenotype-driven study in a large single-center cohort

Cette étude rétrospective monocentrique inclut 966 fœtus porteurs d'anomalies du système nerveux central détectées à l'échographie et/ou à l'IRM fœtale, tous explorés par CNV-seq, le caryotype et l'exome en trio étant réalisés selon l'indication clinique et le choix parental. Un variant pathogène ou probablement pathogène est identifié dans 12,63 % des cas : le rendement du CNV-seq est de 8,07 % (78/966), celui de l'exome en trio de 16,32 % (70/429), avec un gain de 10,92 % (44/403) après CNV-seq négatif. Le CNV-seq est plus rentable dans les formes non isolées (15,41 % contre 4,25 %), et l'exome dans les formes isolées complexes que dans les formes isolées simples (32,56 % contre 9,20 %). Après exclusion des anomalies isolées mineures, les rendements atteignent 15,60 % pour le CNV-seq et 26,67 % pour l'exome, et le rendement augmente avec la sévérité pour la ventriculomégalie et la réduction du périmètre crânien.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Chiffres utiles au conseil prénatal : l'exome en trio apporte un diagnostic chez environ un fœtus sur dix après CNV-seq négatif, et chez près d'un sur trois dans les atteintes isolées mais complexes du système nerveux central. La stratification par phénotype d'imagerie aide à hiérarchiser les indications, en particulier face aux signes mineurs isolés, dont le rendement est plus faible. Étude rétrospective monocentrique, où l'exome n'a été réalisé que chez une partie des fœtus selon l'indication et le choix parental : un biais de sélection pèse sur les rendements de l'exome.

Analyse par Dr Thibaut Benquey