Upfront whole genome and transcriptome sequencing to improve diagnosis in inherited bone marrow failure syndromes

Séquençage du génome et du transcriptome d'emblée sur ADN non hématopoïétique, détectant notamment une disruption génique par rétrotransposon

Le séquençage du génome et du transcriptome d'emblée (WGTS) a été évalué chez 237 patients suspects de syndrome d'insuffisance médullaire héréditaire, à partir d'ADN non hématopoïétique, en contexte accrédité avec retour des résultats en temps réel. L'âge médian était de 29 ans et 34,6 % avaient moins de 18 ans. Un diagnostic moléculaire a été posé chez 87 patients (36,7 %), couvrant notamment thrombopénies héréditaires, maladies des télomères, anémie de Diamond-Blackfan, neutropénies congénitales sévères, syndrome de Shwachman-Diamond et anémie de Fanconi. Quatre patients ont reçu un diagnostic génétique non hématologique et sept des résultats secondaires actionnables ; des mécanismes nouveaux, dont une disruption génique par rétrotransposon, et des associations gène-maladie (THRA, MEIS1, TUBB) ont été établis.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Dans un champ où le chevauchement clinique entre entités et avec l'aplasie acquise est la règle, le génome d'emblée évite l'empilement de panels et capte des mécanismes hors de portée de l'exome. Le transcriptome ajoute une lecture fonctionnelle utile à l'interprétation. La supériorité revendiquée sur les autres approches repose toutefois sur une comparaison indirecte, faute de bras comparatif dans la cohorte.

Analyse par Dr Thibaut Benquey