Multi-ancestry sequencing analysis in 293,141 participants identifies predisposition DNA repair genes associated with HCC risk.

Fardeau de variants rares perte de fonction prédite et faux-sens délétères dans des gènes de réparation de l'ADN (MSH6, BRCA2) associé au risque de carcinome hépatocellulaire.

L'association entre les syndromes de prédisposition de type Lynch ou BRCA1/BRCA2 et le carcinome hépatocellulaire était inconnue. Les auteurs ont analysé des données d'exome et de génome entiers chez 2 594 cas de carcinome hépatocellulaire et 290 547 témoins indemnes de cancer, issus de cinq biobanques et cohortes (Penn Medicine BioBank, All of Us, Mayo Clinic, ESCALON, Million Veteran Program) réparties en six groupes de populations, en se concentrant sur six gènes de réparation de l'ADN : BRCA2, BRIP1, MSH6, PMS2, CHEK2 et FANCA. Dans la population européenne, MSH6 montrait l'association la plus forte, avec un risque multiplié par 2,75 (OR 2,75 ; IC 95 % 1,50-5,04 ; p = 0,001 ; q = 0,02) à une fréquence allélique mineure de 1 %, PMS2 n'atteignant qu'une signification nominale (OR 1,90 ; 1,08-3,34 ; p = 0,03 ; q = 0,09). L'analyse combinée sur l'ensemble des populations renforçait le signal MSH6 (OR 2,53 ; 1,43-4,49 ; q = 0,01) et faisait apparaître une association BRCA2 (OR 2,26 ; 1,39-3,67 ; q = 0,01) à une fréquence allélique mineure de 0,1 %.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Un odds ratio autour de 2,5 sur un cancer dont l'incidence dépend massivement de facteurs hépatiques acquis ne justifie pas à lui seul un programme de surveillance hépatique chez les porteurs MSH6 ou BRCA2. Ce qui manque pour trancher est l'interaction avec la cirrhose, l'hépatite virale et la stéatopathie, absente de cette analyse. À ce stade, l'apport est de faire entrer le carcinome hépatocellulaire dans la discussion du spectre tumoral de MSH6, pas de modifier un protocole de suivi.

Analyse par Dr Thibaut Benquey