Pharmacogenomic biomarkers in oncology: evidence, clinical utility, and barriers to implementation.

Variants germinaux de DPYD, TPMT, NUDT15 et UGT1A1 déterminant le métabolisme, le transport et la toxicité des chimiothérapies, distingués des altérations somatiques d'EGFR, RAS, BRAF et HER2 qui orientent le choix du traitement.

Cette revue propose une évaluation critique des biomarqueurs pharmacogénomiques cliniquement validés en oncologie, en articulant les altérations somatiques qui déterminent la sensibilité tumorale et les variants germinaux qui gouvernent le métabolisme, le transport et la toxicité des médicaments. Les auteurs mettent en avant DPYD, TPMT, NUDT15 et UGT1A1 comme principaux déterminants germinaux d'une adaptation posologique guidée par le génotype, présentée comme un moyen d'améliorer la sécurité sans perte d'efficacité. Les biomarqueurs somatiques EGFR, RAS, BRAF et HER2 restent centraux pour la sélection thérapeutique, l'émergence de résistances justifiant une réévaluation moléculaire itérative. La revue propose un cadre d'implémentation par paliers et discute les obstacles au déploiement ainsi que les perspectives, modèles polygéniques, approches multi-omiques et intelligence artificielle.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le principal défaut de cette synthèse est de réunir sous une même étiquette deux objets qui n'ont ni le même niveau de preuve ni le même circuit : la pharmacogénétique germinale de la toxicité, où DPYD et UGT1A1 relèvent d'une recherche avant prescription, et les biomarqueurs somatiques de sélection tumorale, qui appartiennent à la routine oncologique. Aucune stratégie de recherche documentaire n'est décrite et le cadre d'implémentation par paliers n'est pas validé : c'est une lecture d'orientation, pas une source de preuve. Elle rend service à qui découvre le domaine ; elle n'apporte rien de plus, à qui doit décider d'un test, que les recommandations dédiées.

Analyse par Dr Thibaut Benquey