Genomics-first association of pharmacogenomic risk phenotypes with adverse drug reactions in a healthcare-based population.

Les variants des pharmacogènes modifient le métabolisme des médicaments et définissent des phénotypes de métaboliseur actionnables, associés à un surrisque d'effet indésirable lors de l'exposition au médicament concerné.

Cette analyse rétrospective « génome d'abord » a croisé données génétiques et dossier médical informatisé chez 226 053 participants de la cohorte Geisinger MyCode, pour 58 associations gène-médicament à haut risque listées par le CPIC et couvrant 11 gènes. 93,7 % des participants (211 920/226 053) portaient au moins un phénotype pharmacogénétique actionnable, et 44,4 % (100 402/226 053) cumulaient un phénotype à risque d'effet indésirable et la prescription du médicament correspondant. Les porteurs d'un phénotype à risque avaient plus souvent une allergie documentée ou un arrêt de traitement pour effet indésirable (OR = 1,4 ; P < 0,001), et 3,9 % d'entre eux (8 913/226 053) ont présenté un effet indésirable en lien avec leur propre profil pharmacogénétique. Au total, 36 194 effets indésirables ont été recensés chez 27 546 personnes (12,2 % de la cohorte), dont 10 719 (29,6 %) chez des porteurs d'un phénotype pertinent. L'incidence des effets indésirables augmentait avec le nombre d'expositions médicamenteuses (corrélation de Pearson = 0,50 ; P < 0,001).

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le critère de jugement repose sur des indicateurs indirects extraits du dossier informatisé — allergies déclarées et arrêts de traitement — dont l'imputabilité au génotype n'est pas établie individuellement. L'association reste modeste (OR = 1,4) et ne démontre pas qu'un génotypage préemptif aurait évité ces événements, ce que la conclusion des auteurs formule d'ailleurs au conditionnel. Pour appuyer un déploiement, il faudrait une comparaison prospective avec adjudication des effets indésirables plutôt qu'une reconstruction rétrospective à partir de champs administratifs.

Analyse par Dr Thibaut Benquey