Familial Risk Stratification Across Cancer Syndromes Using Fam3PRO.

Modèle mendélien multigénique estimant, à partir de l'histoire familiale, la probabilité de portage d'un variant pathogène et le risque tumoral futur.

Fam3PRO est une méthode mendélienne de prédiction du risque, conçue pour construire des modèles intégrant un nombre arbitraire de gènes et de cancers, ici paramétrée à partir de données populationnelles de la littérature pour 21 gènes et 17 cancers. Les auteurs la valident sur trois cohortes de panels indépendantes et multiethniques. Fam3PRO offre une discrimination et une calibration comparables à celles des modèles syndrome-spécifiques BRCAPRO et MMRpro pour les gènes des syndromes sein-ovaire et de Lynch. Pour la probabilité d'être hétérozygote pour au moins un variant pathogène parmi les 21 gènes, la discrimination atteint 0,64 (IC 95 % 0,62-0,67) et la calibration observé/attendu 1,13 (IC 95 % 1,05-1,22) dans la cohorte combinée. Aux seuils de probabilité de 2,5 % et 5 %, Fam3PRO identifie davantage d'individus à haut risque de portage que BRCAPRO et MMRpro.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'intérêt est réel pour les consultations qui voient des histoires familiales mixtes ne cadrant avec aucun syndrome unique : un modèle couvrant 21 gènes et 17 cancers évite d'empiler des scores syndrome-spécifiques mal adaptés. La discrimination globale de 0,64 reste toutefois modeste et ne remplace pas le jugement clinique ; les paramètres de pénétrance sont par ailleurs issus de la littérature, avec l'incertitude que cela implique pour les gènes de risque modéré. À éprouver en pratique sur les indications limites de prescription de test.

Analyse par Dr Thibaut Benquey