Comprehensive Genomic Analysis in Hereditary Adrenal and Extra-Adrenal Paragangliomas.

Variants germinaux pathogènes des gènes de prédisposition aux paragangliomes, incluant des variants structuraux tels qu'une duplication en tandem inversée de SDHA dans une tumeur déficiente en succinate déshydrogénase.

Revue rétrospective des dossiers de 110 personnes ayant un paragangliome surrénalien ou extra-surrénalien prises en charge à Toronto entre 2011 et 2023, avec panel germinal ciblé, séquençage du génome entier (WGS) et cartographie optique du génome. Le panel a identifié un variant pathogène ou probablement pathogène chez 28,18 % (31/110) des personnes, et cinq variants de signification incertaine ont été reclassés en pathogène ou probablement pathogène au cours de la période, portant le total à 32,7 % (36/110). Le taux de variants de signification incertaine était comparable entre les groupes (16,28 %, 7/43 pour les origines non européennes ; 17,24 %, 10/58 pour les origines européennes), mais la reclassification vers pathogène était moins fréquente dans le groupe non européen (28,57 %, 2/7 contre 40,0 %, 4/10). Chez sept personnes à tumeur déficiente en succinate déshydrogénase et panel non contributif, le WGS a identifié un variant pathogène dans 6 cas sur 7 (85,7 %), et la cartographie optique a résolu une duplication en tandem inversée impliquant SDHA que le WGS seul ne caractérisait pas complètement. Des variants pathogènes incidents ont également été trouvés dans des gènes sans association établie au paragangliome, dont TSC1 et PALB2.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

La stratégie proposée — panel large et immunohistochimie SDHB en première intention, WGS et cartographie optique réservés aux cas non résolus — correspond à ce que font déjà beaucoup de laboratoires ; l'apport est de chiffrer le gain des techniques de seconde intention, mais sur sept patients seulement, effectif trop faible pour fonder un seuil décisionnel. L'écart de reclassification des variants de signification incertaine selon l'origine déclarée porte sur des effectifs de 7 et 10 personnes et doit être lu comme un signal à surveiller, non comme une inégalité démontrée. La série est monocentrique et s'étend sur douze ans, période pendant laquelle les critères d'interprétation et les techniques ont changé, ce qui limite la comparabilité interne.

Analyse par Dr Thibaut Benquey