Clinically actionable genetic findings by exome sequencing performed for therapeutic purposes in children with very-high risk cancer included the MAPPYACTS study.

Variants pathogènes ou probablement pathogènes germinaux dans 184 gènes de prédisposition au cancer et 49 gènes actionnables hors cancer (liste ACMG SF v3.1), détectés par un WES germinal réalisé à visée théranostique

Le séquençage réalisé pour guider le traitement des cancers pédiatriques offre l'occasion d'identifier des variants germinaux de prédisposition et d'autres affections héréditaires actionnables. Dans l'essai MAPPYACTS, un WES germinal était disponible pour 674 patients atteints de cancers en rechute ou réfractaires, analysés sur 184 gènes de prédisposition au cancer et 49 gènes actionnables hors cancer de la liste ACMG SF v3.1 ; 98,6 % des familles ont consenti au rendu de ces résultats. Au total, 148 variants pathogènes ou probablement pathogènes ont été identifiés chez 130 patients (19,3 %) dans 53 gènes de prédisposition, et un conseil génétique a été recommandé pour 58 patients (8,6 %), les gènes les plus fréquents étant TP53 (n = 17), DICER1 (n = 5) et BRCA1 (n = 4). Les découvertes de prédisposition correspondaient au spectre tumoral attendu dans 48 % des cas, dont 35 % n'avaient pas été reconnus auparavant. Par ailleurs, 10 patients (1,5 %) portaient un variant actionnable dans un gène hors cancer (cardiomyopathies, hypercholestérolémie familiale, amylose à transthyrétine).

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'acceptation quasi totale du rendu (98,6 %) montre que la difficulté n'est pas le consentement mais l'organisation : qui interprète, qui restitue, qui prend en charge. L'écart entre 19,3 % de patients porteurs d'un variant pathogène ou probablement pathogène et 8,6 % de conseils génétiques recommandés illustre le poids du tri clinique (mode de transmission, pertinence), dont les critères sont à lire dans l'article. Dès lors que l'exome est fait pour le traitement, ne pas en lire la composante germinale revient à laisser passer des prédispositions méconnues.

Analyse par Dr Thibaut Benquey