Yield of actionable variants from high-risk cancer gene panel testing in guideline-eligible and ineligible individuals.

Variants pathogènes ou probablement pathogènes germinaux dans un panel multi-cancers de 29 gènes cliniquement actionnables

De nombreux porteurs d'un variant pathogène germinal de prédisposition au cancer ne sont pas identifiés par les critères de test fondés sur l'histoire personnelle et familiale. Cette étude de cohorte rétrospective a analysé 153 767 femmes et hommes non apparentés, consécutifs, non sélectionnés sur leurs antécédents personnels ou familiaux de cancer, adressés pour un test génétique sur plusieurs sites entre juin 2020 et août 2023. Avec un panel multi-cancers de 29 gènes actionnables, un variant pathogène ou probablement pathogène a été identifié chez 6,5 % des individus remplissant les critères nationaux de test et chez 4,8 % de ceux qui ne les remplissaient pas. Au total, 22 % des individus porteurs auraient été manqués si les critères de test avaient été appliqués. Chez les personnes remplissant uniquement les critères de syndrome de Lynch, les taux de positivité étaient par exemple de 0,9 % pour MSH2 (contre 0,05 % hors critères) et de 0,6 % pour MLH1 (contre 0,04 %).

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le chiffre de 22 % de porteurs manqués plaide pour un assouplissement des critères, mais il doit être lu avec prudence : une population « non sélectionnée sur les antécédents » reste une population adressée pour un test, donc déjà orientée par un prescripteur. L'abstract ne dit rien du devenir clinique des porteurs identifiés hors critères, ni de la proportion de variants de signification incertaine rendus. L'argument rejoint celui des approches génomiques larges : la limite tient de moins en moins à la technique et de plus en plus aux critères d'accès au test.

Analyse par Dr Thibaut Benquey