Improving Consistency in Colorectal Cancer Genetic Risk Assessment and Return of Results Through an Integrated Polygenic Risk Score

Score de risque polygénique intégrant 28 scores publiés (stPRS-CRC)

Les scores de risque polygénique (PRS) publiés pour le cancer colorectal ont des performances proches à l'échelle de la population mais classent souvent différemment les mêmes individus, ce qui complique leur mise en œuvre clinique et le retour des résultats. Les auteurs ont construit un score stable, stPRS-CRC, en intégrant 28 PRS publiés avec PRSmix dans la cohorte de développement All of Us (n = 321 703), puis l'ont évalué dans une cohorte de validation All of Us (n = 80 423) et dans la Genomic Health Initiative (n = 17 545). Comparé aux 90 % restants, le décile supérieur de stPRS-CRC est associé au cancer colorectal avec des odds ratios de 1,94, 2,08 et 2,08 dans les trois cohortes, comparables à ceux du meilleur PRS individuel (PGS003852). La concordance individuelle de la classification à haut risque, mesurée par l'indice de Jaccard moyen, est meilleure avec stPRS-CRC qu'avec PGS003852 (0,29 contre 0,20, 0,43 contre 0,25 et 0,27 contre 0,19 ; p < 0,001).

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le travail s'attaque à un vrai frein au retour de résultats : deux PRS équivalents en population peuvent classer différemment un même patient. Le gain porte sur la cohérence du classement, pas sur la discrimination, et un odds ratio d'environ 2 pour le décile supérieur reste modeste au regard des syndromes monogéniques ; il s'agit en outre d'un preprint non relu. Un score polygénique ne remplace pas la recherche d'un variant constitutionnel chez un patient à histoire personnelle ou familiale évocatrice.

Analyse par Dr Thibaut Benquey