Limitations of VKORC1 rs9934438 as a Surrogate Marker for Vitamin K Antagonist Dose Adjustment.

VKORC1

Le variant promoteur rs9923231 de VKORC1 détermine la sensibilité aux antivitamines K ; le variant intronique rs9934438, supposé en fort déséquilibre de liaison avec lui, est parfois utilisé comme substitut.

Le variant promoteur rs9923231 de VKORC1 est le marqueur de référence du dosage génotype-guidé des antivitamines K, mais le variant intronique rs9934438 est parfois utilisé comme substitut. Cette étude rétrospective monocentrique a génotypé les deux variants chez 939 patients par panel TaqMan OpenArray. La concordance était globalement élevée, mais rs9934438 a mal classé deux patients qui, d'après rs9923231, relevaient d'une réduction de dose, soit des faux négatifs potentiels. Les auteurs recommandent d'utiliser préférentiellement rs9923231.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'enjeu est surtout technique : deux discordances sur 939 patients ne remettent pas en cause les panels existants, mais elles rappellent qu'un marqueur de substitution doit être validé avant de remplacer le variant causal dans un test. Le message pratique est de cibler directement rs9923231 lorsque c'est possible.

Analyse par Dr Thibaut Benquey