Homologous recombination deficiency-driven genomic instability in ovarian cancer as an indicator of BRCA1 and BRCA2 variant pathogenicity

Le score d'instabilité génomique lié au déficit de recombinaison homologue (HRD) comme critère probant ACMG/AMP pour la pathogénicité des variants *BRCA1/2*

Ce projet du consortium ENIGMA évalue, sur 4 943 cancers de l'ovaire de haut grade (765 porteurs de variant pathogène BRCA1/2), si le score d'instabilité génomique HRD (test MyChoice HRD+ CDx) peut servir de critère probant pour la classification ACMG/AMP des variants BRCA1/2. Un statut HRD-GIS élevé (≥42) donne un rapport de vraisemblance de 3,03 en faveur de la pathogénicité (évidence « supporting »), tandis qu'un score bas (LR 0,13) constitue une évidence bénigne modérée. Concrètement, 91 % des tumeurs BRCA-mutées étaient HRD-GIS élevé contre 30 % des tumeurs sauvages. Cette approche fournit une donnée quantifiée directement intégrable au framework de classification, particulièrement pour les VUS.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Voilà une utilisation élégante d'un test compagnon déjà réalisé en routine onco-thérapeutique pour alimenter la classification germinale des variants — une rare convergence entre médecine somatique et constitutionnelle. Le rapport de vraisemblance calibré sur le modèle bayésien ACMG est immédiatement exploitable en réunion de classification. L'apport principal sera la reclassification de VUS BRCA1/2, point de blocage majeur du conseil génétique, sans surcoût analytique quand le test HRD a déjà été fait.