Implementation and early outcomes of an in-house DPYD genotyping program for fluoropyrimidine safety.

DPYD

Une activité réduite de la dihydropyrimidine déshydrogénase, liée à des variants de DPYD, expose à une toxicité sévère des fluoropyrimidines, d'où la réduction de dose guidée par le génotype dès le premier cycle.

Le génotypage préthérapeutique de DPYD est appuyé par les recommandations, mais sa mise en œuvre reste inégale lorsque le test, l'interprétation et le rendu du résultat ne sont pas intégrés aux circuits de soins. Cette cohorte observationnelle prospective, menée de mai 2024 à juillet 2025 dans un centre de cancérologie multisite, à la fois communautaire et universitaire, évalue un programme interne de génotypage par TaqMan (c.1905+1G>A, c.1679T>G, c.1236G>A comme proxy de c.1129-5923C>G, c.2846A>T et c.557A>G) intégré au circuit de prétraitement, avec un pipeline automatisé qui produit une note versée au dossier après validation du directeur médical. Sur 617 patients génotypés, 505 traités par fluoropyrimidine ont été analysés : 439 (86,9 %) ont été testés avant le traitement, mais seuls 197 sur 439 (44,9 %) disposaient du résultat avant le premier cycle. Vingt-deux patients (4,4 %) étaient hétérozygotes pour un variant de DPYD (c.1236G>A chez 11, c.2846A>T chez 5, c.1905+1G>A chez 4, c.557A>G chez 2) ; dans la cohorte testée avant traitement, 10 patients hétérozygotes sur 21 (47,6 %) ont eu une réduction de dose au premier cycle, dont 9 documentées comme guidées par le génotype. Des événements indésirables sévères ayant nécessité une évaluation en urgence ou une hospitalisation sont survenus chez 5 patients sur 505 (1,0 %), l'un d'eux étant hétérozygote pour c.1236G>A avec un résultat revenu après le début du traitement.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le résultat utile est organisationnel : le facteur limitant n'est pas le délai analytique mais le rendu du résultat avant la première décision thérapeutique, puisque seuls 44,9 % des patients testés avant traitement en disposaient au premier cycle, si bien que changer de technique de génotypage ne réglerait pas le problème. Les données cliniques sont trop maigres pour conclure : 5 événements sévères en tout, dont un seul rattaché à un porteur dont le résultat était tardif, et aucun comparateur pour chiffrer ce qu'ont évité les 9 réductions de dose guidées par le génotype. C'est une démonstration de faisabilité, qui plaide pour verrouiller le délai de rendu dans le circuit de prescription avant d'y voir la preuve d'un bénéfice.

Analyse par Dr Thibaut Benquey