A zero-parameter first-principles gate framework for full-length TP53 missense variant interpretation

Cadre analytique sans paramètre libre (Gate & Channel) combinant physicochimie, structure 3D et polymères intrinsèquement désordonnés pour la classification complète des variants faux-sens de *TP53*

Gate & Channel est un cadre analytique sans paramètre libre (zero-parameter) pour l'interprétation des variants faux-sens sur la longueur complète de TP53, combinant les propriétés physicochimiques, la structure 3D (domaines globulaires et régions intrinsèquement désordonnées). Validé sur 1 369 variants avec une sensibilité de 84,5 % et une VPP de 89,1 %, il capture les 9 hotspots oncogéniques connus. L'outil est open-source (Python, pathogenicity-gates) et entièrement reproductible sans données d'entraînement.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

TP53 est le gène le plus fréquemment muté dans les cancers, avec une charge VUS considérable en oncogénétique (syndrome de Li-Fraumeni) et en oncologie somatique. Un outil premiers principes sans biais d'entraînement, avec PPV de 89 % et capturant tous les hotspots, est une contribution précieuse pour la classification des VUS TP53.