Clinical application of long-read sequencing in newborn genetic screening for congenital adrenal hyperplasia.

Variants pathogènes bialléliques de CYP21A2, génotypés en séquençage long-read chez le nouveau-né.

Le dépistage néonatal de l'hyperplasie congénitale des surrénales reposant sur la seule 17α-hydroxyprogestérone (17α-OHP) a des performances diagnostiques limitées. Les auteurs ont évalué le séquençage long-read en dépistage néonatal primaire et secondaire, dans une cohorte rétrospective de 100 145 nouveau-nés (centre de dépistage du Fujian, 2019) et une cohorte prospective de 2 100 nouveau-nés (mai 2023) testés simultanément par 17α-OHP et analyse génétique. Dans la cohorte rétrospective, le taux de positivité de la 17α-OHP était de 0,19 % (190/100 145 ; IC 95 % 0,17-0,21 %) et cinq enfants ont eu un diagnostic confirmé, soit une prévalence de 1/20 029 ; le génotypage long-read a identifié les variants pathogènes de CYP21A2 chez ces cinq nouveau-nés. Dans la cohorte prospective, deux nouveau-nés (1/1050) à 17α-OHP normale portaient des variants pathogènes bialléliques de CYP21A2, et 88 (4,2 %) à 17α-OHP normale portaient un variant hétérozygote lié à la maladie, dont 85 dans CYP21A2 répartis en 32 génotypes distincts. Les fréquences de porteurs calculées étaient de 1/78 pour la forme classique et 1/40 pour la forme non classique.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le point opérationnel n'est pas le rendement du dosage biochimique mais les deux nouveau-nés bialléliques à 17α-OHP normale sur 2 100 : l'abstract ne dit ni s'ils étaient symptomatiques, ni comment ils ont été suivis, ce qui laisse ouverte la question de ce que l'on dépiste réellement. Le travail est monocentrique et les fréquences de porteurs annoncées dérivent d'un effectif prospectif de 2 100 sujets, donc avec des intervalles de confiance larges. Avant d'envisager une génomique de première intention en dépistage néonatal, il faudrait une valeur prédictive positive et des données de devenir clinique issues de plusieurs centres.

Analyse par Dr Thibaut Benquey