Landscape of germline genetic alterations among non-western young male patients with cancer. Findings from The Jordanian exploratory cancer genetics study.

Variants germinaux pathogènes/probablement pathogènes de gènes de prédisposition, dominés par APC, MLH1, MSH2, MUTYH, BRCA2 et TP53.

Le programme jordanien Jo-ECAG a proposé un panel germinal multigène à 652 hommes de 50 ans ou moins porteurs d'une tumeur solide nouvellement diagnostiquée, indépendamment du type tumoral, du stade et de l'histoire familiale. Le cancer colorectal dominait la série (48,0 %), devant les cancers gastrique (6,7 %), pancréatique (6,4 %) et testiculaire (6,0 %). Au total, 90 patients (13,8 %) portaient un variant pathogène ou probablement pathogène et 216 (33,1 %) un variant de signification incertaine. Le rendement était plus élevé chez les patients répondant aux critères NCCN (16,5 % contre 4,7 %, p<0,001) et augmentait aux âges les plus jeunes (26,3 % entre 18 et 30 ans contre 9,7 % entre 41 et 50 ans, p<0,001). Les gènes les plus fréquemment altérés étaient APC, MLH1, MSH2, MUTYH, BRCA2 et TP53, sans aucun variant pathogène de BRCA1.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le chiffre qui compte pour la consultation est le 4,7 % de rendement chez les hommes ne remplissant pas les critères NCCN : c'est peu par rapport aux patients éligibles, mais bien assez pour rendre difficile de justifier un refus de test devant un cancer solide avant 50 ans. Le taux de variants de signification incertaine, un tiers de la série, est le vrai coût de cette stratégie large et devra être absorbé par un travail d'interprétation, pas par un élargissement supplémentaire du nombre de gènes ciblés. L'absence de variant BRCA1 et la surreprésentation du colorectal reflètent le recrutement d'un centre unique de référence : ce spectre n'est pas transposable tel quel à une population non sélectionnée.

Analyse par Dr Thibaut Benquey