An update on APC I1307K homozygosity: observations from a large multigene panel testing cohort.

APC

Allèle de susceptibilité APC c.3902T>A (p.Ile1307Lys) à l'état hétérozygote ou homozygote, créant un segment poly-adnine instable

L'allèle APC c.3902T>A (p.Ile1307Lys) est associé, chez les hétérozygotes ashkénazes, à des odds de cancer colorectal multipliés par 1,7 dans la littérature, mais le risque des homozygotes reste inconnu et repose sur de très petits effectifs. Les auteurs ont comparé, dans une cohorte de laboratoire de diagnostic, 340 hétérozygotes et 74 homozygotes à 372 individus porteurs d'un syndrome de Lynch lié à MSH6 et à 19 809 individus négatifs pour l'allèle I1307K, pour MSH6 et pour tout autre variant rapportable. Les homozygotes montraient une tendance à des odds de cancer colorectal augmentés par rapport à ces derniers (OR 2,48 ; p = 0,074), sans différence pour les hétérozygotes (OR 0,94 ; p = 0,83). Les porteurs d'un variant MSH6 avaient des odds supérieurs à ceux des homozygotes en comparaison directe (OR 3,54 ; p < 0,0001), différence qui disparaissait en régression logistique (OR 1,19 ; p = 0,78). Les auteurs concluent que la taille de l'échantillon et le biais de sélection ne permettent pas de distinguer un risque modestement augmenté d'une absence de risque.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Il faut lire ce travail pour ce qu'il est, une étude négative : le résultat principal (OR 2,48 ; p = 0,074) ne franchit pas le seuil de significativité, et les auteurs disent eux-mêmes qu'ils ne peuvent pas trancher entre risque modeste et absence de risque. L'absence complète de signal chez les hétérozygotes, contraire au facteur 1,7 de la littérature, illustre surtout la limite d'un schéma cas-témoins mené à l'intérieur d'une population déjà sélectionnée pour être testée, où les témoins sont eux-mêmes des consultants d'oncogénétique. En pratique rien ne change : l'homozygotie I1307K ne justifie pas une surveillance de type Lynch, et la question du risque réel appelle une cohorte populationnelle plutôt qu'une nouvelle série de laboratoire.

Analyse par Dr Thibaut Benquey