Does Next Generation Sequencing (NGS)-Based CYP2D6 Sequencing Improve Genotype-Phenotype Concordance in Tamoxifen-Treated Patients?

Le séquençage NGS de *CYP2D6* améliore la concordance génotype-phénotype par rapport au génotypage ciblé en détectant les variants rares et les variants structuraux

Une étude rétrospective de 68 patients traités par tamoxifène compare le génotypage CYP2D6 ciblé (TaqMan/Luminex) au séquençage NGS complet. Le NGS modifie la classification du phénotype dans 19 % des cas, principalement en détectant des variants rares, des duplications et des gènes hybrides manqués par les approches ciblées. Ces reclassifications ont un impact pharmacocinétique démontré sur l'exposition au tamoxifène (mesurée par endoxifène).

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Un taux de 19 % de reclassification phénotypique avec le NGS vs génotypage ciblé est cliniquement significatif pour CYP2D6. Dans le contexte du tamoxifène — où le phénotype métaboliseur détermine la conversion en endoxifène actif et potentiellement l'efficacité thérapeutique — ce résultat plaide pour l'adoption du NGS dans les programmes de PGx en oncologie.