A Decade of Hereditary Cancer Genetic Testing Results in Asian Indian population: Retrospective Study.

Panels NGS multigéniques germinaux complétés par MLPA, révélant un variant fondateur récurrent de BRCA1 (c.68_69delAG) et une prédominance des gènes MMR (MLH1, MSH2, MSH6) dans les cancers colorectaux et de l'endomètre.

Les grands jeux de données décrivant la distribution des variants germinaux à l'échelle de l'Inde manquaient jusqu'ici. Cette analyse rétrospective porte sur 23 070 individus testés dans un laboratoire de Bangalore entre 2016 et 2025 par panels NGS multigéniques validés, avec MLPA pour la recherche de variations de nombre de copies dans un sous-groupe, répartis en cancers du sein (n = 10 486), de l'ovaire (n = 3 990), colorectaux (n = 1 275), de la prostate (n = 765), de l'endomètre (n = 541) et individus asymptomatiques (n = 2 775). Le rendement global était de 23,85 %, maximal dans les cancers colorectaux (42 %) et de l'ovaire (31,6 %), suivis de l'endomètre (22,6 %), du sein (20,2 %) et de la prostate (8,6 %), et atteignait 18,9 % chez les asymptomatiques à histoire familiale positive et 24,2 % dans les cancers du sein diagnostiqués à 50 ans ou avant. BRCA1 et BRCA2 dominaient dans les cancers du sein et de l'ovaire, les gènes MMR (MLH1, MSH2, MSH6) dans les cancers colorectaux et de l'endomètre, et BRCA2 dans les cancers de la prostate, le variant fondateur BRCA1 c.68_69delAG étant retrouvé chez 358 individus, devant un variant d'épissage canonique c.5074+1G>A (n = 123) et un variant non-sens c.3607C>T (n = 44). La réanalyse des VUS et des cas non résolus améliorait le rendement d'environ 5 points en moyenne, et la décroissance du rendement avec l'âge conduit les auteurs à privilégier un test universel plutôt que fondé sur les critères d'éligibilité.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

L'apport propre de cette cohorte n'est pas le rendement global, attendu pour une population adressée, mais la démonstration qu'une poignée de variants récurrents de BRCA1 concentre une part substantielle des résultats positifs : cela ouvre la possibilité d'un test de première intention ciblé et peu coûteux en Inde et dans la diaspora sud-asiatique, avant panel complet. La réserve est méthodologique : il s'agit de données de laboratoire commercial, sans phénotype vérifié ni suivi clinique, avec un biais d'indication majeur, si bien que l'argument en faveur du test universel repose sur une simple décroissance du rendement avec l'âge et non sur une comparaison de stratégies. Le gain de 5 points obtenu par réanalyse des VUS est le chiffre le plus directement transposable à nos pratiques.

Analyse par Dr Thibaut Benquey