Clinical Function Assignment of NAT2 Alleles by the Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium Pharmacogene Curation Expert Panel

NAT2 code l'arylamine N-acétyltransférase 2, enzyme de phase II acétylant les arylamines et les arylhydrazines ; les allèles étoile de NAT2 modulent cette activité et reçoivent désormais une fonction clinique standardisée (augmentée, diminuée, incertaine, inconnue).

NAT2 code l'arylamine N-acétyltransférase 2, enzyme de phase II qui acétyle les arylamines et les arylhydrazines dont l'isoniazide, et son polymorphisme très marqué explique la répartition variable des acétyleurs rapides et lents selon les populations. Le panel international et pluridisciplinaire de curation du CPIC dédié à NAT2 (NAT2-PCEP) a passé en revue l'ensemble de la littérature in vitro et clinique disponible afin d'évaluer la concordance génotype-phénotype et la fonction biochimique de chaque allèle. Les 59 allèles étoile catalogués par PharmVar ont reçu une fonction clinique selon la terminologie standard du CPIC : fonction augmentée pour deux allèles seulement, NAT2 1 et NAT2 4 (historiquement dits rapides), fonction diminuée pour 40 allèles (historiquement dits lents), fonction incertaine pour 10 et fonction inconnue pour 7. Les auteurs soulignent que cette harmonisation des termes de fonction allélique et des correspondances diplotype-phénotype conditionne l'implémentation clinique fiable des résultats de génotypage NAT2.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Ce texte ne dit pas quelle dose prescrire, mais il règle le problème en amont qui bloquait tout le reste : jusqu'ici, l'étiquette d'acétyleur lent recouvrait des réalités hétérogènes selon les laboratoires et les publications, ce qui rendait les études difficilement comparables. Passer de la dichotomie rapide/lent à une fonction explicite, allèle par allèle, rend enfin superposables les comptes rendus de génotypage NAT2 d'un centre à l'autre, et met en évidence les 17 allèles laissés en fonction incertaine ou inconnue, autant de zones grises qu'il faudra documenter. Pour le prescripteur d'isoniazide, la traduction posologique viendra d'une future recommandation CPIC ; pour le biologiste, ce référentiel s'applique dès maintenant à la rédaction de ses comptes rendus.

Analyse par Dr Thibaut Benquey