A frequently occurring MSH2 variant in Iraqi and Chaldean patients with Lynch syndrome: evidence for a putative founder variant.

MSH2

Variant pathogène récurrent MSH2 c.932delA (p.Asn311ThrfsTer20), évoquant un variant fondateur dans la population irakienne et chaldéenne

Le syndrome de Lynch est la première cause de cancers colorectal et de l'endomètre héréditaires, mais on en sait peu sur cette maladie dans les populations irakienne et chaldéenne et, plus largement, dans celles du Moyen-Orient et d'Afrique du Nord. Les auteurs ont analysé les dossiers d'un centre de génétique oncologique à haut volume entre janvier 2008 et mars 2024 : sur 483 patients avec un syndrome de Lynch, 60 (12,4 %) déclaraient une ascendance irakienne ou chaldéenne, et 53 d'entre eux (88,3 %), issus de 22 familles distinctes, portaient le même variant pathogène de MSH2, c.932delA (p.Asn311ThrfsTer20), détecté uniquement dans cette population. Vingt-huit de ces 53 personnes (52,8 %) avaient au moins un cancer associé au syndrome de Lynch (17 colorectaux, 12 de l'endomètre, 7 rénaux ou urothéliaux, 6 de l'ovaire et un carcinome sébacé), dont 16 (57,1 %) avaient plusieurs tumeurs malignes, et l'âge moyen de survenue du cancer colorectal était de 49,6 ans. Quatorze familles (63,6 %) ont eu un test en cascade, qui a identifié 31 porteurs de ce variant de MSH2 dans la cohorte et 25 vrais négatifs. Les auteurs présentent ce premier signalement d'un variant récurrent MSH2 c.932delA chez des patients irakiens et chaldéens atteints de syndrome de Lynch comme un argument en faveur d'un variant fondateur putatif, et estiment que d'autres études sont nécessaires pour caractériser le syndrome dans cette population.

Synthèse rédigée par Geno'X. Pour l'abstract original complet, consulter la publication source.

Le signal est net : 88,3 % des patients d'ascendance irakienne ou chaldéenne avec un syndrome de Lynch portent le même variant, dans 22 familles distinctes, ce qui plaide pour tester en priorité c.932delA chez un patient de cette ascendance suspect de syndrome de Lynch. Le qualificatif de fondateur reste toutefois une hypothèse : le résumé ne rapporte aucune analyse d'haplotype, le recrutement provient d'un seul centre de génétique oncologique, et la proportion de porteurs atteints (52,8 %) ne peut se lire comme une pénétrance dans une série de patients vus en consultation. L'intérêt opérationnel apparaît dans le test en cascade, réalisé dans 14 familles, qui a identifié 31 porteurs et 25 vrais négatifs.

Analyse par Dr Thibaut Benquey